忌将石灰与发酵腐熟好的粪肥混合使用： 有的人在用石灰进行土壤消毒时，习惯将粪肥与石灰一起翻入土壤，这样虽省时省力，但因石灰呈碱性，它与发酵腐熟好的粪肥混合使用时就会与肥料中的腐殖酸等发生反应，不仅会降低肥料的使用效果，还会削弱石灰的杀菌效果。正确的做法是，先将石灰深翻入土，间隔3-4天再施粪肥，这样可以减少石灰与粪肥的接触，防止降低杀菌效果及肥效。忌石灰施用量过大： 有些人只知道氢氧化钙石灰具有杀菌效果，但不知道使用多少合适，于是为达到杀菌效果，使用的量过大，有的甚至每亩使用量在500公斤以上，导致土壤碱性过高，使得一些在中性及酸性条件下容易被蔬菜吸收利用的元素如磷、锌、镁、铁、硼等被固定，影响了蔬菜根系对这些营养元素的吸收，导致蔬菜生长不良，生长点出现白化等现象。

氢氧化钙石灰在食用菌栽培中的应用是广泛的，可以进行环境消毒，物料消毒。石灰在水中的溶解度很低，只要1/100就可达到饱和。一般用3/100----5/100的石灰乳剂，对环境及培养料表面进行消毒。在对培养料表面进行消毒时用量浓度不可过大，过大会妨碍菌丝的正常生长。生产中要根据实际情况灵活掌握。如果料面较湿，撒一层干的石灰粉就可杀死青霉，毛霉。要是料面干燥，可喷5/100---10/100的石灰乳剂。当发生胡桃肉状菌，棉絮状菌时，可先喷乳剂后再在料面撒一层石灰粉，双管齐下。 石灰也不是所有的食用菌都适用的。在培养料中加入适量的石灰对侧耳类，金针菇，黄背木耳等有益无害。配置培养料时加入干料的1/100---5/100的石灰粉可以促进或不影响菌丝生长。且能抑制杂菌的生长。栽培香菇，猴头菇是不能加入石灰粉的。