化学消毒法的实质就是将破碎后的医疗废物与一定浓度的消毒剂(次、过氧乙酸、戊二醛、臭氧等)混合作用，并保证其与消毒药剂有足够的接触面积和时间 ，有机物在消毒过程中被分解、生物被杀灭。消毒药剂与医疗废物 接触是保障处理效果的前提。通过使用旋转式破碎设备提高破碎程度，保证消毒剂能够将其穿透。化学消毒法适合处理液体医疗废物和病理方面的垃圾，近也在逐步用于那些无法通过加热或润湿进行消毒灭菌的医疗废物的处理。
4.2 影响参数
决定化学消毒法效果的因素主要有消毒剂浓度和作用温度，根据废物性质选择具有相应pH值的消毒剂，废物和药剂接触混合时间、流体的再循环等也是重要因素。
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